[exercise] translate psth exercise

spike_trains/exercises/psth.tex

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 %%%%% text size %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
 \usepackage[left=20mm,right=20mm,top=25mm,bottom=25mm]{geometry}
-\pagestyle{headandfoot} \header{{\bfseries\large \"Ubung
-    }}{{\bfseries\large Zeitabh\"angige Feuerrate}}{{\bfseries\large 13. Dezember, 2016}}
+\pagestyle{headandfoot} \header{{\bfseries\large Exercise
+    }}{{\bfseries\large Time-dependent firing rate}}{{\bfseries\large December, 12, 2017}}
 \firstpagefooter{Dr. Jan Grewe}{Phone: 29 74588}{Email:
   jan.grewe@uni-tuebingen.de} \runningfooter{}{\thepage}{}
 
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 \renewcommand{\baselinestretch}{1.15}
 
 \newcommand{\code}[1]{\texttt{#1}}
-\renewcommand{\solutiontitle}{\noindent\textbf{L\"osung:}\par\noindent}
+\renewcommand{\solutiontitle}{\noindent\textbf{Solution}\par\noindent}
 
 %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 
 \begin{document}
 
 \vspace*{-6.5ex}
 \begin{center}
-  \textbf{\Large Einf\"uhrung in die wissenschaftliche Datenverarbeitung}\\[1ex]
+  \textbf{\Large Introduction to scientific computing.}\\[1ex]
   {\large Jan Grewe, Jan Benda}\\[-3ex]
   Abteilung Neuroethologie \hfill --- \hfill Institut f\"ur Neurobiologie \hfill --- \hfill \includegraphics[width=0.28\textwidth]{UT_WBMW_Black_RGB} \\
 \end{center}
 
 \begin{questions}
-  \question Stelle die zeitabh\"angige Feuerrate eines Neurons
-  dar. Diese soll auf Basis der instantanen Feuerrate (des
-  Interspikeintervals) berechnet werden. Verwende dazu den Datensatz
-  \code{lifoustim.mat}. Dieser enth\"at drei Variablen: 1. die
-  Spikezeiten, 2. den Stimulus und 3. die zeitliche Aufl\"osung. Die
-  Dauer eines Trials betr\"agt 30 Sekunden.
+  \question Plot the time-dependent firing rate of a neuron. Calculate
+  the firing rate from the instantaneous firing rate (based on the
+  interspike interval). Use the \code{lifoustim.mat}. The dataset
+  contains three variables. 1st the spike times in different trials,
+  2nd the stimulus, and 3rd the temporal resolution. The total
+  duration of each trial amounts to 30 seconds.
+
   \begin{parts}
-    \part Schreibe eine Funktion, die einen Vektor mit Spikezeiten,
-    die Dauer des Trials, und die zeitliche Aufl\"osung entgegennimmt
-    und die Zeitachse sowie die Feuerrate zur\"uckgibt.
-    \part Benutze diese Funktion in einem Skript und stellt die Feuerrate
-    eines einzelnen Trials sowie den Mittelwert \"uber alle Trials
-    dar.
-    \part Erweitere das Programm so, dass die Abbildung den Richtlinien
-    des \textit{Journal of Neuroscience} entspricht
-    (Schriftgr\"o{\ss}e, Abbildungsgr\"o{\ss}e).
-    \part Die Abbildung sollte als pdf gespeichert werden.
+    \part{} Write a function that takes three arguments: the spike
+    times of a single trial, the trial duration and the temporal
+    resolution.  The function should return the time values and the
+    firing rate in $Hz$.
+    \part{} Write a script that applies the above function to estimate
+    the firing rate of each trial. Plot a single individual responses
+    and the average response as a function of time into the same plot.
+    \part{} Extend your program that it saves the figure in a format
+    according to the rules given by the \textit{Journal of
+      Neuroscience}. This relates to the figure size and the
+    fontsizes.
+    \part{} Store the figure in pdf format.
   \end{parts}
 
-  \question Wie zuvor nur unter Verwendung der Binning Methode.
+  \question{} As before but use the binning method.
+
+  \question{} Extend your script that it also plots the interspike
+  interval histogram and the distribution of spike counts into
+  separate figures. Save the figures to file using the pdf format.
 
-  \question Entscheide dich f\"ur eine Varainte und erweitere das
-  entsprechende Skript, sodass auch die Interspikeintervallverteilung
-  und die Verteilung der Spikecounts graphisch dargestellt werden. Die
-  entsprechenden Abbildungen sollten als pdf gespeichert werden.
-  
-  \question Einige Trials sind anders als die \"Ubrigen. Benutze den
-  Rasterplot um sie zu finden. Speichere die generierten Abbildungen.
+  \question{} Some trials are different from the others.
   \begin{parts}
-    \part Benutze den Rasterplot um sie zu finden. Worin unterscheiden sie sich von den anderen?
-    \part Plotte die Verteilung der Spike counts.
-    \part Filtere all die Trials heraus, deren Spikecount mehr als
-    $2\sigma$ vom Mittelwert abweicht.
-    \part Plotte die Feuerrate vor und nach dem Filtern.
+    \part{} Use the rasterplot to identify them. In which sense
+    are they different from the others? Save the rasterplot in pdf
+    format.
+    \part{} Identify those trial in which the total spike count
+    deviates more than $2\sigma$ from the average.
   \end{parts}
 \end{questions}