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programming/exercises/day_1_exercises.tex

@@ -131,20 +131,21 @@ T\"ubingen, Abt. Neuroethologie }}
 
 \newpage
 \section{Boolesche Operationen}
+
 \begin{enumerate}
-  \item Gegeben sind \verb+x = (1:10)+ und
-    \verb+y = [3 1 5 6 8 2 9 4 7 0]+. Try to understand the following
-    commands.
-    \begin{enumerate}
-    \item \verb+x( (y <= 2) )+
-    \item \verb+x( (x > 2) | (y < 8) )+
-    \item \verb+x( (x == 0) \& (y == 0) )+
-    \end{enumerate}
-  \item Erzeuge eine 100x100 2-D Matrix mit Zufallswerten zwischen 0 und 100 (\verb+randi+). Ersetze \verb+x < 33+ mit 0, \verb+x >= 33 und x < 66+ mit 1 und alle \verb+x >= 66+ auf 2.
-  \item Ermittle die Anzahl Elemente fuer jede Klasse mithilfe eines Booleschen Ausdrucks.
+\item Gegeben sind zwei Vektoren \verb+x = [1 5 2 8 9 0 1]+ und
+  \verb+y = [5 2 2 6 0 0 2]+. F\"uhre aus und erkl\"are.
+  \begin{enumerate}
+  \item \verb+x > y+
+  \item \verb+y < x+
+  \item \verb+x == y+
+  \item \verb+x ~= y+
+  \item \verb+x & ~y+
+  \item \verb+x | y+
+  \end{enumerate}
 \end{enumerate}
 
-
+\newpage
 \section{Logische Indizierung}
 \begin{enumerate}
   \item Gegeben sind \verb+x = (1:10)+ und
@@ -153,12 +154,13 @@ T\"ubingen, Abt. Neuroethologie }}
     \begin{enumerate}
     \item \verb+x( (y <= 2) )+
     \item \verb+x( (x > 2) | (y < 8) )+
-    \item \verb+x( (x == 0) \& (y == 0) )+
+    \item \verb+x( (x == 0) & (y == 0) )+
     \end{enumerate}
   \item Erzeuge eine 100x100 2-D Matrix mit Zufallswerten zwischen 0 und 100 (\verb+randi+). Ersetze \verb+x < 33+ mit 0, \verb+x >= 33 und x < 66+ mit 1 und alle \verb+x >= 66+ auf 2.
   \item Ermittle die Anzahl Elemente fuer jede Klasse mithilfe eines Booleschen Ausdrucks.
 \end{enumerate}
 
+
 \newpage
 \section{Kontrollstrukturen}
 

programming/exercises/psths.m

@@ -0,0 +1,16 @@
+load('ampullary.mat')
+fig = figure();
+
+%% create PSTH on the basis of the interspike intervals
+fig.sub
+% 1. get the interspike intervals for each trial
+for i = 1:size(times,2)
+   isi = diff(times{i});
+    
+end
+
+%% create PSTH using the binning method
+
+
+
+%% create PSTH using the kernel-convolution method

programming/lectures/plotting_spike_trains.tex

@@ -201,9 +201,8 @@
   \textbf{P}eri- \textbf{S}timulus - \textbf{T}ime - \textbf{H}istogram
   \begin{figure}
     \centering
-    %\includegraphics[width=0.375\columnwidth]{images/rasterplot}
+    \includegraphics[width=0.75\columnwidth]{images/psth}
   \end{figure}
-  Wof\"ur eignet sich ein solcher Rasterplot (auch \textit{dotdisplay} genannt)?
 \end{frame}
 
 

programming/lectures/programming_basics.tex

@@ -855,7 +855,7 @@ Alternativ zum ``subscript indexing'' koennen die Elemente von Matrizen auch lin
     \begin{enumerate}
     \item \verb+x( (y <= 2) )+
     \item \verb+x( (x > 2) | (y < 8) )+
-    \item \verb+x( (x == 0) \& (y == 0) )+
+    \item \verb+x( (x == 0) & (y == 0) )+
     \end{enumerate}
   \item Erzeuge eine 100x100 2-D Matrix mit Zufallswerten zwischen 0 und 100 (\verb+randi+). Ersetze \verb+x < 33+ mit 0, \verb+x >= 33 und x < 66+ mit 1 und alle \verb+x >= 66+ auf 2.
   \item Ermittle die Anzahl Elemente fuer jede Klasse mithilfe eines Booleschen Ausdrucks.

programming/lectures/scripts_functions.tex

@@ -140,7 +140,7 @@
   \end{itemize}\pause
   Wenn es zum Leben erweckt wird...
   \begin{itemize}
-  \item ... wird es Zeile fuer Zeile von oben nach unten ausgef\"urht.
+  \item ... wird es Zeile fuer Zeile von oben nach unten ausgef\"uhrt.
   \end{itemize}
 \end{frame}
 
@@ -155,9 +155,9 @@
     \item Objekte (werden wir ignorieren)
     \end{enumerate}\pause
   \item Alle werden in sogenannte m-files gespeichert (z.B. \textit{meinProgramm.m}).
-  \item Koennen dann von der Kommandozeile aufgerufen werden.
-  \item Programme erhoehen die Wiederverwertbarkeit von Programmcode.
-  \item Programme koennen andere Programme aufrufen.
+  \item K\"onnen dann von der Kommandozeile aufgerufen werden.
+  \item Programme erh\"ohen die Wiederverwertbarkeit von Programmcode.
+  \item Programme k\"onnen andere Programme aufrufen.
   \end{itemize}
 \end{frame}
 
@@ -313,6 +313,7 @@ function y = plot_sinus(frequenz, amplitude)
   \end{enumerate}
 \end{frame}
 
+
 \begin{frame}[fragile]
   \frametitle{Programmierstil}
   Ihr d\"urft all das missachten und einen eingenen Stil entwickeln. Aber:\\
@@ -327,26 +328,6 @@ function y = plot_sinus(frequenz, amplitude)
 \end{frame}
 
 
-\begin{frame}[fragile]
-  \frametitle{Funktionen}
-  \frametitle{\"Ubungen}
-  \begin{enumerate}
-  \item Schreibe eine Funktion \verb+plotSineWave+ die die amplitude
-    des Sinus als Argument entgegennimmt.
-  \item Erweitere die Funktion in der Weise, dass sie zus\"atzlich die
-    gew\"uenschte Frequnez \"ubernimmt.
-  \item Erweitere \verb+plotSineWave+ so, dass sie eine Schar von
-    Sinuswellen unterschiedlicher Frequenz plottet.
-  \item Erweitere \verb+plotSinWave+ so, dass auch die Amplitude als
-    Vektor \"ubergeben werden kann. Die Funktion soll alle m\"oglichen
-    Kombinationen darstellen.
-  \item Erweitere \verb+plotSinWave+ so, dass die berechnete Sinus in einer 2-D Matrize zurckgegeben werden.
-  \item F\"uge zwei weitere R\"uckgabeparameter hinzu, die f\"ur jede
-    Berechnung die Amplitude und Frequenz zur\"uckgeben.
-  \end{enumerate}
-\end{frame}
-
-
 \begin{frame}[plain]
   \huge{4. Vom Problem zum Algorithmus zum Programm}\\
   \begin{figure}
@@ -355,11 +336,12 @@ function y = plot_sinus(frequenz, amplitude)
   \end{figure}
 \end{frame}
 
+
 \begin{frame}
   \frametitle{Vom Problem zum Algorithmus}
   \framesubtitle{Uff, schwierig...}
   \begin{enumerate}
-  \item Am besten f\"angt man mit einem wei\{ss}en Blatt an. :-) \pause
+  \item Am besten f\"angt man mit einem weissen Blatt an. :-) \pause
   \item Begr\"abt alle Angst vor Fehlern. \pause
   \item Macht sich klar, was das die Ausgangsituation ist.\pause
   \item Macht sich klar, was das Ziel ist.\pause
@@ -367,9 +349,30 @@ function y = plot_sinus(frequenz, amplitude)
   \end{enumerate}  
 \end{frame}
 
+
+\begin{frame}[fragile]
+  \frametitle{Vom Problem zum Algorithmus}
+  \frametitle{\"Ubungen - Funktionen}
+  \begin{enumerate}
+  \item Schreibe eine Funktion \verb+plotSineWave+ die die Amplitude
+    des Sinus als Argument entgegennimmt.
+  \item Erweitere die Funktion in der Weise, dass sie zus\"atzlich die
+    gew\"uenschte Frequenz \"ubernimmt.
+  \item Erweitere \verb+plotSineWave+ so, dass sie eine Schar von
+    Sinuswellen unterschiedlicher Frequenz plottet.
+  \item Erweitere \verb+plotSinWave+ so, dass auch die Amplitude als
+    Vektor \"ubergeben werden kann. Die Funktion soll alle m\"oglichen
+    Kombinationen darstellen.
+  \item Erweitere \verb+plotSinWave+ so, dass die berechnete Sinus in einer 2-D Matrize zurckgegeben werden.
+  \item F\"uge zwei weitere R\"uckgabeparameter hinzu, die f\"ur jede
+    Berechnung die Amplitude und Frequenz zur\"uckgeben.
+  \end{enumerate}
+\end{frame}
+
+
 \begin{frame}
   \frametitle{Vom Problem zum Algorithmus}
-  \framesubtitle{Uff, schwierig...}
+  \framesubtitle{\"Ubungen - eine Herausforderung}
   Wie w\"are es mit folgendem Problem:\\ 
   Ich habe die Aufnahme des Membranpotentials einer Nervenzelle... 
   \begin{enumerate}