[lecture] plotting_spikes initial changes, unifinished

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Jan Grewe 2015-10-12 00:07:27 +02:00
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commit 7445d19620

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@ -52,10 +52,10 @@
Universit\"at T\"ubingen} Universit\"at T\"ubingen}
\institute[Wissenschaftliche Datenverarbeitung]{} \institute[Wissenschaftliche Datenverarbeitung]{}
\date{03.10.2014 - 07.11.2014} \date{12.10.2015 - 06.11.2015}
%\logo{\pgfuseimage{../../resources/UT_BM_Rot_RGB.pdf}} %\logo{\pgfuseimage{../../resources/UT_BM_Rot_RGB.pdf}}
\subject{Einf\"uhrung in wissenschaftliche Datenverarbeitung} \subject{Einf\"uhrung in die wissenschaftliche Datenverarbeitung}
\vspace{1em} \vspace{1em}
\titlegraphic{ \titlegraphic{
\includegraphics[width=0.5\linewidth]{../../resources/UT_WBMW_Rot_RGB} \includegraphics[width=0.5\linewidth]{../../resources/UT_WBMW_Rot_RGB}
@ -113,9 +113,9 @@
\frametitle{Tagesmen\"u} \frametitle{Tagesmen\"u}
\begin{enumerate} \begin{enumerate}
\item Graphische Darstellung von Daten I \item Graphische Darstellung von Daten I
\item Fortgeschrittene Datenstrukturen I \item Fortgeschrittene Datenstrukturen und Navigation im
Dateisystem.
\item Spiketrain Analyse I \item Spiketrain Analyse I
\item Navigieren im Dateisystem
\item \"Ubungen, \"Ubungen, \"Ubungen. \item \"Ubungen, \"Ubungen, \"Ubungen.
\end{enumerate} \end{enumerate}
\end{frame} \end{frame}
@ -204,12 +204,33 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
\begin{frame}[plain] \begin{frame}[plain]
\huge{2. Fortgeschrittene Datenstrukturen I} \huge{2. Fortgeschrittene Datenstrukturen}
\end{frame}
\begin{frame}[fragile]
\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
\framesubtitle{Strukturen}
\end{frame}
\begin{frame}[fragile]
\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
\framesubtitle{Strukturen}
\end{frame}
\begin{frame}[fragile]
\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
\framesubtitle{Navigieren im Dateisystem}
\end{frame} \end{frame}
\begin{frame} \begin{frame}
\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen I} \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
\framesubtitle{Cell Arrays} \framesubtitle{Cell Arrays}
\begin{enumerate} \begin{enumerate}
\item Matrizen k\"onnen nur rechtwinklig sein.\pause \item Matrizen k\"onnen nur rechtwinklig sein.\pause
@ -219,8 +240,9 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
\end{enumerate} \end{enumerate}
\end{frame} \end{frame}
\begin{frame}[fragile] \begin{frame}[fragile]
\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen I} \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
\framesubtitle{Cell Arrays} \framesubtitle{Cell Arrays}
\scriptsize \scriptsize
\begin{lstlisting} \begin{lstlisting}
@ -241,6 +263,7 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
\end{lstlisting} \end{lstlisting}
\end{frame} \end{frame}
\begin{frame}[plain] \begin{frame}[plain]
\huge{3. Spiketrain Analyse I} \huge{3. Spiketrain Analyse I}
\end{frame} \end{frame}
@ -261,9 +284,11 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
\framesubtitle{Rasterplot} \framesubtitle{Rasterplot}
\"Ubung: \"Ubung:
\begin{enumerate} \begin{enumerate}
\item Ladet die Datei: electrorecptor\_spike\_times.mat aus dem Ilias Ordner. \item Ladet die Datei: electrorecptor\_spike\_times.mat aus dem
Ilias Ordner.
\item Der Datensatz enth\"alt die Zeiten von Aktionspotentialen. \item Der Datensatz enth\"alt die Zeiten von Aktionspotentialen.
\item Schaut euch den Inhalt und skizziert wie das Problem gel\"ost werden k\"onnte. \item Schaut euch den Inhalt und skizziert wie das Problem gel\"ost
werden k\"onnte.
\item Erzeugt einen Rasterplot. \item Erzeugt einen Rasterplot.
\end{enumerate} \end{enumerate}
\end{frame} \end{frame}
@ -271,10 +296,12 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
\begin{frame} \begin{frame}
\frametitle{Spiketrain Analyse I} \frametitle{Spiketrain Analyse I}
\framesubtitle{Feuerrate \"uber die Zeit} \framesubtitle{Feuerrate \"uber
die Zeit}
\begin{enumerate} \begin{enumerate}
\item Die Feuerrate kann aus dem Abstand zwischen zwei \item Die Feuerrate kann aus dem Abstand zwischen zwei
aufeinanderfolgenden Aktionspotentialen (\textbf{Interspikeinterval}) berechnet werden. \pause aufeinanderfolgenden Aktionspotentialen
(\textbf{Interspikeinterval}) berechnet werden. \pause
\item Auch als \textbf{Instantane Feuerrate} bezeichnet. \item Auch als \textbf{Instantane Feuerrate} bezeichnet.
\end{enumerate} \end{enumerate}
\begin{figure} \begin{figure}
@ -286,7 +313,8 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
\begin{frame} \begin{frame}
\frametitle{Spiketrain Analyse I} \frametitle{Spiketrain Analyse I}
\framesubtitle{Feuerrate \"uber die Zeit} \framesubtitle{Feuerrate \"uber
die Zeit}
\begin{enumerate} \begin{enumerate}
\item Z.B. das \textbf{P}eri- \textbf{S}timulus - \textbf{T}ime - \item Z.B. das \textbf{P}eri- \textbf{S}timulus - \textbf{T}ime -
\textbf{H}istogram, \textbf{PSTH} \textbf{H}istogram, \textbf{PSTH}