[lecture] plotting_spikes initial changes, unifinished
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aabf6cb5f7
commit
7445d19620
@ -52,10 +52,10 @@
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Universit\"at T\"ubingen}
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\institute[Wissenschaftliche Datenverarbeitung]{}
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\date{03.10.2014 - 07.11.2014}
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\date{12.10.2015 - 06.11.2015}
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%\logo{\pgfuseimage{../../resources/UT_BM_Rot_RGB.pdf}}
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\subject{Einf\"uhrung in wissenschaftliche Datenverarbeitung}
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\subject{Einf\"uhrung in die wissenschaftliche Datenverarbeitung}
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\vspace{1em}
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\titlegraphic{
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\includegraphics[width=0.5\linewidth]{../../resources/UT_WBMW_Rot_RGB}
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@ -113,9 +113,9 @@
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\frametitle{Tagesmen\"u}
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\begin{enumerate}
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\item Graphische Darstellung von Daten I
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\item Fortgeschrittene Datenstrukturen I
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\item Fortgeschrittene Datenstrukturen und Navigation im
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Dateisystem.
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\item Spiketrain Analyse I
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\item Navigieren im Dateisystem
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\item \"Ubungen, \"Ubungen, \"Ubungen.
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\end{enumerate}
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\end{frame}
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@ -204,12 +204,33 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
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\begin{frame}[plain]
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\huge{2. Fortgeschrittene Datenstrukturen I}
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\huge{2. Fortgeschrittene Datenstrukturen}
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\end{frame}
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\begin{frame}[fragile]
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\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
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\framesubtitle{Strukturen}
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\end{frame}
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\begin{frame}[fragile]
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\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
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\framesubtitle{Strukturen}
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\end{frame}
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\begin{frame}[fragile]
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\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
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\framesubtitle{Navigieren im Dateisystem}
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\end{frame}
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\begin{frame}
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\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen I}
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\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
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\framesubtitle{Cell Arrays}
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\begin{enumerate}
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\item Matrizen k\"onnen nur rechtwinklig sein.\pause
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@ -219,8 +240,9 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
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\end{enumerate}
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\end{frame}
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\begin{frame}[fragile]
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\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen I}
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\frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
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\framesubtitle{Cell Arrays}
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\scriptsize
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\begin{lstlisting}
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@ -241,6 +263,7 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
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\end{lstlisting}
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\end{frame}
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\begin{frame}[plain]
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\huge{3. Spiketrain Analyse I}
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\end{frame}
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@ -261,20 +284,24 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
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\framesubtitle{Rasterplot}
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\"Ubung:
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\begin{enumerate}
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\item Ladet die Datei: electrorecptor\_spike\_times.mat aus dem Ilias Ordner.
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\item Der Datensatz enth\"alt die Zeiten von Aktionspotentialen.
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\item Schaut euch den Inhalt und skizziert wie das Problem gel\"ost werden k\"onnte.
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\item Erzeugt einen Rasterplot.
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\item Ladet die Datei: electrorecptor\_spike\_times.mat aus dem
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Ilias Ordner.
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||||
\item Der Datensatz enth\"alt die Zeiten von Aktionspotentialen.
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||||
\item Schaut euch den Inhalt und skizziert wie das Problem gel\"ost
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werden k\"onnte.
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||||
\item Erzeugt einen Rasterplot.
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\end{enumerate}
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\end{frame}
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\begin{frame}
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\frametitle{Spiketrain Analyse I}
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\framesubtitle{Feuerrate \"uber die Zeit}
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\framesubtitle{Feuerrate \"uber
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die Zeit}
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\begin{enumerate}
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\item Die Feuerrate kann aus dem Abstand zwischen zwei
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aufeinanderfolgenden Aktionspotentialen (\textbf{Interspikeinterval}) berechnet werden. \pause
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aufeinanderfolgenden Aktionspotentialen
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(\textbf{Interspikeinterval}) berechnet werden. \pause
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\item Auch als \textbf{Instantane Feuerrate} bezeichnet.
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\end{enumerate}
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\begin{figure}
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@ -286,7 +313,8 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
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\begin{frame}
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\frametitle{Spiketrain Analyse I}
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\framesubtitle{Feuerrate \"uber die Zeit}
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\framesubtitle{Feuerrate \"uber
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die Zeit}
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\begin{enumerate}
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\item Z.B. das \textbf{P}eri- \textbf{S}timulus - \textbf{T}ime -
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\textbf{H}istogram, \textbf{PSTH}
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