Merge branch 'master' of whale.am28.uni-tuebingen.de:scientificComputing

spike_trains/exercises/xcorr.tex

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+%%%%% text size %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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+\pagestyle{headandfoot} \header{{\bfseries\large \"Ubung
+    }}{{\bfseries\large Korrelation Stimulus und Antwort}}{{\bfseries\large 20. Dezember, 2016}}
+\firstpagefooter{Dr. Jan Grewe}{Phone: 29 74588}{Email:
+  jan.grewe@uni-tuebingen.de} \runningfooter{}{\thepage}{}
+
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+\newcommand{\code}[1]{\texttt{#1}}
+\renewcommand{\solutiontitle}{\noindent\textbf{L\"osung:}\par\noindent}
+
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%% 
+\begin{document}
+
+\vspace*{-6.5ex}
+\begin{center}
+  \textbf{\Large Einf\"uhrung in die wissenschaftliche Datenverarbeitung}\\[1ex]
+  {\large Jan Grewe, Jan Benda}\\[-3ex]
+  Abteilung Neuroethologie \hfill --- \hfill Institut f\"ur Neurobiologie \hfill --- \hfill \includegraphics[width=0.28\textwidth]{UT_WBMW_Black_RGB} \\
+\end{center}
+
+\begin{questions}
+  \question Stellt die zeitabh\"angige Feuerrate eines Neurons
+  dar. Diese soll mit der Faltungsmethode bestimmt werden. Verwendet
+  den Datensatz \code{lifoustim.mat}. Dieser enth\"at drei Variablen:
+  1. die Spikezeiten, 2. den Stimulus und 3. die zeitliche
+  Aufl\"osung. Die Dauer eines Trials betr\"agt 30 Sekunden.
+  \begin{parts}
+    \part Schreibt eine Funktion, die einen Vektor mit Spikezeiten,
+    die Dauer des Trials, und die zeitliche Aufl\"osung entgegennimmt
+    und die Zeitachse sowie die Feuerrate zur\"uckgibt.
+    \part Benutzt diese Funktion in einem Skript und stellt die Feuerrate
+    eines einzelnen Trials sowie den Mittelwert \"uber alle Trials
+    dar.
+    \part Erweitert das Programm so, dass die Abbildung den Richtlinien
+    des \textit{Journal of Neuroscience} entspricht
+    (Schriftgr\"o{\ss}e, Abbildungsgr\"o{\ss}e).
+    \part Die Abbildung sollte als pdf gespeichert werden.
+  \end{parts}
+
+  \question In einer vorherigen \"Ubung wurde die Korrelation zwischen
+  einer Reihe von Messungen und einer entsprechenden Anzahl
+  unabh\"angiger Variablen bestimmt (Kapitel 4.4 im Skript). Wir
+  k\"onnen diese Korrelation benutzen um den Zusammenhang zwischen
+  Stimulus und Antwort zu bestimmen.
+  \begin{parts}
+    \part Ermittelt die zeitabh\"angige Feuerrate mit einer der drei
+    Methoden und korrelliert sie mit dem Stimulus.
+    \part Verschiebt nun den Stimulus relativ zur Antwort um $\pm$
+    50\,ms in 1\,ms Schritten und berechnet f\"ur jede Verschiebung
+    die Korrelation.
+    \part Stellt die so berechnete Kreuzkorrelation graphisch dar
+    (x-Achse die Verschiebung, y-Achse der Korrelationskoeffizient).
+    \part Was ist die maximale Korrelation und bei welcher
+    Verschiebung kommt sie vor?
+    \part Was k\"onnte uns die Breite des Korrelationspeaks sagen?
+  \end{parts}
+\end{questions}
+
+\end{document}