xaveros/jar_project
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xaver 2020-09-22 14:37:01 +02:00
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@ -1,20 +1,13 @@
- zeigen: sin_all_uniform - sin_all_normal (also 5Hz, let away 0.001Hz?, gain_fit), eigenmannia_jar, plot_eigenmannia_jar(compare res_df_%s / res_df_%s_new),
fish_properties(step_response_eigen does not work (norming/mean_trace)), phaseshift_all, gewicht größe von vanessa
+ größe/gewicht/dominanz/temp/eod basefrequenz/... , scatter plot gegen cutoff frequency, ...
- cutoff - dominance score
- cutoff - basefrequency
- gain - dominance_score: für gain predict machen pro fish, passt diese zeitkonstante?
- mit daten befassen (fish_properties!
+ eigenmannia: specgram von pre_data neben specgram von data machen um zu sehen ob analyse fehler oder fehler in import_data
- erkenntnis: hab bei bm/jm nicht den gleichen mean abgezogen..
- an sich res_df besser, jedoch immer noch relativ variabel
- -2Hz bei meisten negative JAR?
- evtl. doch mean anstatt median für response am ende?
+ look at step eigen data
- norming of data: what if in norm = ground / jar with jar == 0.0?
+ look at 5Hz data - compare
+ to step response eigenmannia and eigenmannia response to deltaf, to now absolute JAR --> should i go to relative? (relative didnt work for me somehow)
+ sin_all_uniform - sin_all_normal (also 5Hz, let away 0.001Hz?, gain_fit): fit als spur reinlegen damit klar wird aus was gerade besteht
+ eigenmannia_jar:
- pre_data und data aneinanderlegen damit nur noch ein specgram und keine lücke, absolute differenz lassen
- specgram auch zeigen, vorallem was auch die ausreißer bei -2 Hz betreffen
+ plot_eigenmannia_jar(compare res_df_%s / res_df_%s_new)
+ fish_properties:
- step_response eigen: hier für fit relative JAR mit Normierung, bei Normierung einfach wenn j < 1Hz raus oderso
- hauptsächlich auf f_c und tau konzentrieren, vor allem auch beides auftragen, gewicht/größe noch nehmen
+ phaseshift_all: wenn negativer gain in fit --> +pi rechnen
+ Q10 Wert aus Formel von Jan auf base_frequenz rechnen
long term:
- extra datei mit script drin um fertige daten darzustellen, den fit-code nur zur datenverarbeitung verwenden