29.09

notes

@@ -1,13 +1,42 @@
-+ sin_all_uniform - sin_all_normal (also 5Hz, let away 0.001Hz?, gain_fit): fit als spur reinlegen damit klar wird aus was gerade besteht
-+ eigenmannia_jar:
-    - pre_data und data aneinanderlegen damit nur noch ein specgram und keine lücke, absolute differenz lassen
-    - specgram auch zeigen, vorallem was auch die ausreißer bei -2 Hz betreffen
-+ plot_eigenmannia_jar(compare res_df_%s / res_df_%s_new)
-+ fish_properties:
-    - step_response eigen: hier für fit relative JAR mit Normierung, bei Normierung einfach wenn j < 1Hz raus oderso
-    - hauptsächlich auf f_c und tau konzentrieren, vor allem auch beides auftragen, gewicht/größe noch nehmen
++ figures:
+    apteronotus: fundament by tims bachelor thesis, important that apteronotus only shifts his frequency up (as eigenmannia doesnt --> natalies measurements)
+    + spectogram
+    + jar trace out of specgram
+    + filtering of jar trace: mean noise cut --> subtracting jar response over whole stimulus
+    + fit and jar trace --> gain and phaseshift
+!!! + this for different am-frequencies and delta f (-15/-5Hz) --> compare gain for them
+    + gain curve for one or more single fish
+    + fit of gain curve for cutoff frequency and tau
+    + gain curve for all fish taken together
+    + single gain curves inside gain curve for all fish --> different cutoff frequencies --> comparison to metzen/chacron
+    --> fig_apt_specgram,
+        fig_apt_jar_filter_fit,
+        fig_apt_rms_gaincurve,
+        fig_apt_gaincurve_cutoff_tau,
+        sin_all_normal (without single gaincurves),
+        sin_all_uniform (with gaincurves for 5Hz)
+
+    eigenmannia:
+    + deltaf / response: -2Hz different, show it
+    + spectogram
+    + direct to fit and jar trace --> gain and phaseshift   DURCH SIN RESPONSE SPEC JAGEN!
+    + gain curve for one or more single fish
+    + gain curve for all fish taken together
+    - (step response eigen)
+
+    fish properties:
+    + parameters
+    + cutoff frequency - dominance score
++ eigenmannia deltaf response over all fish mean
 + phaseshift_all: wenn negativer gain in fit --> +pi rechnen, dann modulo
-+ Q10 Wert aus Formel von Jan auf base_frequenz rechnen (adjust-eodf in jar_functions)
+- plot_eigenmannia_jar(compare res_df_%s / res_df_%s_new)
+- eigenmannia_jar:
+    - specgram auch zeigen, vorallem was auch die ausreißer bei -2 Hz betreffen
+- fish_properties:
+    - hauptsächlich auf f_c und tau konzentrieren, vor allem auch beides auftragen, gewicht/größe noch nehmen
+- step_response eigen: absolute response
+- Q10 Wert aus Formel von Jan auf base_frequenz rechnen (adjust-eodf in jar_functions)
+- sin_all_uniform - sin_all_normal (also 5Hz, let away 0.001Hz?, gain_fit): fit als spur reinlegen damit klar wird aus was gerade besteht
 
 long term:
 - extra datei mit script drin um fertige daten darzustellen, den fit-code nur zur datenverarbeitung verwenden