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\documentclass[12pt,a4paper,pdftex]{exam}
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\usepackage[german]{babel}
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\usepackage{natbib}
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\usepackage{graphicx}
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\usepackage[small]{caption}
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\usepackage{sidecap}
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\usepackage{pslatex}
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\usepackage{amsmath}
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\usepackage{amssymb}
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\setlength{\marginparwidth}{2cm}
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\usepackage[breaklinks=true,bookmarks=true,bookmarksopen=true,pdfpagemode=UseNone,pdfstartview=FitH,colorlinks=true,citecolor=blue]{hyperref}
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%%%%% text size %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
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\usepackage[left=20mm,right=20mm,top=25mm,bottom=25mm]{geometry}
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\pagestyle{headandfoot} \header{{\bfseries\large \"Ubung
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}}{{\bfseries\large Zeitabh\"angige Feuerrate}}{{\bfseries\large 13. Dezember, 2016}}
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\firstpagefooter{Dr. Jan Grewe}{Phone: 29 74588}{Email:
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jan.grewe@uni-tuebingen.de} \runningfooter{}{\thepage}{}
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\setlength{\baselineskip}{15pt}
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\setlength{\parindent}{0.0cm}
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\setlength{\parskip}{0.3cm}
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\renewcommand{\baselinestretch}{1.15}
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\newcommand{\code}[1]{\texttt{#1}}
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\renewcommand{\solutiontitle}{\noindent\textbf{L\"osung:}\par\noindent}
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\begin{document}
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\vspace*{-6.5ex}
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\begin{center}
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\textbf{\Large Einf\"uhrung in die wissenschaftliche Datenverarbeitung}\\[1ex]
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{\large Jan Grewe, Jan Benda}\\[-3ex]
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Abteilung Neuroethologie \hfill --- \hfill Institut f\"ur Neurobiologie \hfill --- \hfill \includegraphics[width=0.28\textwidth]{UT_WBMW_Black_RGB} \\
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\end{center}
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\begin{questions}
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\question Stelle die zeitabh\"angige Feuerrate eines Neurons
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dar. Diese soll auf Basis der instantanen Feuerrate (des
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Interspikeintervals) berechnet werden. Verwende dazu den Datensatz
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\code{lifoustim.mat}. Dieser enth\"at drei Variablen: 1. die
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Spikezeiten, 2. den Stimulus und 3. die zeitliche Aufl\"osung. Die
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Dauer eines Trials betr\"agt 30 Sekunden.
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\begin{parts}
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\part Schreibe eine Funktion, die einen Vektor mit Spikezeiten,
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die Dauer des Trials, und die zeitliche Aufl\"osung entgegennimmt
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und die Zeitachse sowie die Feuerrate zur\"uckgibt.
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\part Benutze diese Funktion in einem Skript und stellt die Feuerrate
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eines einzelnen Trials sowie den Mittelwert \"uber alle Trials
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dar.
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\part Erweitere das Programm so, dass die Abbildung den Richtlinien
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des \textit{Journal of Neuroscience} entspricht
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(Schriftgr\"o{\ss}e, Abbildungsgr\"o{\ss}e).
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\part Die Abbildung sollte als pdf gespeichert werden.
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\end{parts}
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\question Wie zuvor nur unter Verwendung der Binning Methode.
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\question Entscheide dich f\"ur eine Varainte und erweitere das
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entsprechende Skript, sodass auch die Interspikeintervallverteilung
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und die Verteilung der Spikecounts graphisch dargestellt werden. Die
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entsprechenden Abbildungen sollten als pdf gespeichert werden.
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\question Einige Trials sind anders als die \"Ubrigen. Benutze den
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Rasterplot um sie zu finden. Speichere die generierten Abbildungen.
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\begin{parts}
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\part Benutze den Rasterplot um sie zu finden. Worin unterscheiden sie sich von den anderen?
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\part Plotte die Verteilung der Spike counts.
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\part Filtere all die Trials heraus, deren Spikecount mehr als
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$2\sigma$ vom Mittelwert abweicht.
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\part Plotte die Feuerrate vor und nach dem Filtern.
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\end{parts}
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\end{questions}
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\end{document}
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