little changes to plotting, new data structs slides

programming/lectures/data_structures.tex

@@ -0,0 +1,167 @@
+\documentclass{beamer}
+\usepackage{xcolor}
+\usepackage{listings}
+\usepackage{pgf}
+%\usepackage{pgf,pgfarrows,pgfnodes,pgfautomata,pgfheaps,pgfshade} 
+%\usepackage{multimedia}
+
+\usepackage[english]{babel}
+\usepackage{movie15}
+\usepackage[latin1]{inputenc}
+\usepackage{times}
+\usepackage{amsmath}
+\usepackage{bm} 
+\usepackage[T1]{fontenc}
+\usepackage[scaled=.90]{helvet}
+\usepackage{scalefnt}
+\usepackage{tikz}
+\usepackage{ textcomp }
+\usepackage{soul}
+\usepackage{hyperref}
+\definecolor{lightblue}{rgb}{.7,.7,1.}
+\definecolor{mygreen}{rgb}{0,1.,0}
+
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
+\mode<presentation>
+{
+  \usetheme{Singapore}
+  \setbeamercovered{opaque}
+  \usecolortheme{tuebingen}
+  \setbeamertemplate{navigation symbols}{}
+  \usefonttheme{default}
+  \useoutertheme{infolines}
+  % \useoutertheme{miniframes}
+}
+
+\AtBeginSection[]
+{
+  \begin{frame}<beamer>
+    \begin{center}
+      \Huge \insertsectionhead
+    \end{center}
+    % \frametitle{\insertsectionhead}
+    % \tableofcontents[currentsection,hideothersubsections]
+  \end{frame}
+}
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%5
+
+\setbeamertemplate{blocks}[rounded][shadow=true]
+
+\title[]{Scientific Computing -- Grundlagen der Programmierung }
+\author[]{Jan Grewe\\Abteilung f\"ur Neuroethologie\\
+  Universit\"at T\"ubingen}
+
+\institute[Wissenschaftliche Datenverarbeitung]{}
+ \date{12.10.2015 - 06.11.2015}
+ %\logo{\pgfuseimage{../../resources/UT_BM_Rot_RGB.pdf}}
+
+\subject{Einf\"uhrung in die wissenschaftliche Datenverarbeitung}
+\vspace{1em}
+\titlegraphic{
+  \includegraphics[width=0.5\linewidth]{../../resources/UT_WBMW_Rot_RGB}
+}
+%%%%%%%%%% configuration for code
+\lstset{
+ basicstyle=\ttfamily,
+ numbers=left,
+ showstringspaces=false,
+ language=Matlab,
+ commentstyle=\itshape\color{darkgray},
+ keywordstyle=\color{blue},
+ stringstyle=\color{green},
+ backgroundcolor=\color{blue!10},
+ breaklines=true,
+ breakautoindent=true,
+ columns=flexible,
+ frame=single,
+ captionpos=b,
+ xleftmargin=1em,
+ xrightmargin=1em,
+ aboveskip=10pt
+ }
+%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
+\newcommand{\mycite}[1]{
+\begin{flushright}
+\tiny \color{black!80} #1
+\end{flushright}
+}
+
+\input{../../latex/environments.tex}
+\makeatother
+ 
+\begin{document} 
+
+\begin{frame}[plain]
+  \frametitle{}
+  \vspace{-1cm}
+  \titlepage % erzeugt Titelseite
+\end{frame}
+
+\begin{frame}[plain]
+\huge{1. Fortgeschrittene Datenstrukturen}
+\end{frame}
+
+
+
+\begin{frame}[fragile]
+  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
+  \framesubtitle{Strukturen}
+  \begin{itemize}
+  \item Strukturen werden benutzt um beliebige zusammengeh\"orige
+    Daten in sog. Kontainern zu speichern.
+  \item Diese Daten k\"onnen über den Namen des Kontainers oder
+    ``Feldes'' angesprochen werden.
+  \item Man kann Listen von diesen Strukturen haben.
+  \end{itemize}
+\end{frame}
+ 
+
+\begin{frame}[fragile]
+  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
+  \framesubtitle{Strukturen}
+  Beispiel:
+  
+\end{frame}
+
+\begin{frame}[fragile]
+  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
+  \framesubtitle{Navigieren im Dateisystem}
+  
+\end{frame}
+
+
+\begin{frame}
+  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
+  \framesubtitle{Cell Arrays}
+  \begin{enumerate}
+  \item Matrizen k\"onnen nur rechtwinklig sein.\pause
+  \item Manchmal hat man aber unterschiedlich viele Datenpunkte, die
+    dennoch logisch zusammengeh\"oren.\pause
+  \item Z.B. Wenn man Zeitpunkte von Neuronalen- oder Verhaltensereignissen hat.
+  \end{enumerate}
+\end{frame}
+
+
+\begin{frame}[fragile]
+  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
+  \framesubtitle{Cell Arrays}
+  \scriptsize
+  \begin{lstlisting}
+>> % create a cell array
+>> cell_array = {};
+>>
+>> % assignment of arbitrary content
+>> cell_array{1} = ones(100,1);
+>> cell_array{2} = ones(10000,100);
+>> cell_array{3} = 'das ist ein Test';
+>> cell_array{4} = {};
+>>
+>> % accessing of content
+>> size(cell_array{1})
+  ans = 
+     100     1
+>>
+  \end{lstlisting}
+\end{frame}
+
+\end{document}

programming/lectures/plotting_spike_trains.tex

@@ -97,25 +97,12 @@
   \titlepage % erzeugt Titelseite
 \end{frame}
 
-\begin{frame}[plain]
-  \frametitle{Rekapitulation}
-  \begin{enumerate}
-  \item Was ist ein Programm\pause
-  \item Skripte\pause
-  \item Funktionen\pause
-  \item Vom Problem zum Algorithmus
-  \end{enumerate}
-\end{frame}
-
-
 \begin{frame}
   \frametitle{Grundlagen der Programmierung}
   \frametitle{Tagesmen\"u}
   \begin{enumerate}
-  \item Graphische Darstellung von Daten I
+  \item Graphische Darstellung von Daten
-  \item Fortgeschrittene Datenstrukturen und Navigation im
+  \item Spiketrain Analyse
-    Dateisystem.
-  \item Spiketrain Analyse I
   \item \"Ubungen, \"Ubungen, \"Ubungen. 
   \end{enumerate}
 \end{frame}
@@ -203,69 +190,10 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
 \end{frame}
 
 
-\begin{frame}[plain]
-\huge{2. Fortgeschrittene Datenstrukturen}
-\end{frame}
-
-
-
-\begin{frame}[fragile]
-  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
-  \framesubtitle{Strukturen}
-  
-\end{frame}
- 
-
-\begin{frame}[fragile]
-  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
-  \framesubtitle{Strukturen}
-  
-\end{frame}
-
-\begin{frame}[fragile]
-  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
-  \framesubtitle{Navigieren im Dateisystem}
-  
-\end{frame}
-
-
-\begin{frame}
-  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
-  \framesubtitle{Cell Arrays}
-  \begin{enumerate}
-  \item Matrizen k\"onnen nur rechtwinklig sein.\pause
-  \item Manchmal hat man aber unterschiedlich viele Datenpunkte, die
-    dennoch logisch zusammengeh\"oren.\pause
-  \item Z.B. Wenn man Zeitpunkte von Neuronalen- oder Verhaltensereignissen hat.
-  \end{enumerate}
-\end{frame}
-
-
-\begin{frame}[fragile]
-  \frametitle{Fortgeschrittene Datenstrukturen}
-  \framesubtitle{Cell Arrays}
-  \scriptsize
-  \begin{lstlisting}
->> % create a cell array
->> cell_array = {};
->>
->> % assignment of arbitrary content
->> cell_array{1} = ones(100,1);
->> cell_array{2} = ones(10000,100);
->> cell_array{3} = 'das ist ein Test';
->> cell_array{4} = {};
->>
->> % accessing of content
->> size(cell_array{1})
-  ans = 
-     100     1
->>
-  \end{lstlisting}
-\end{frame}
 
 
 \begin{frame}[plain]
-\huge{3. Spiketrain Analyse I}
+\huge{2. Spiketrain Analyse I}
 \end{frame}
 
 
@@ -377,6 +305,4 @@ saveas(fig, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
   \end{figure}
 \end{frame}
 
-
-
 \end{document}