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Jan Grewe 2015-10-28 09:10:00 +01:00
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22
spike_trains/exercises/psth.tex
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@ -37,17 +37,21 @@
\end{center} \end{center}
\begin{questions} \begin{questions}
\question Graphische Darstellung der zeitabh\"angigen Antwort eines \question Stellt die zeitabh\"angigen Feuerrate eines Neurons als
Neurons. PSTH auf Basis der instantanen Feuerrate. Verwendet den Datensatz \code{} PSTH dar. Das PSTH soll auf Basis der instantanen Feuerrate (des
Interspikeintervals) berechnet werden. Verwendet den Datensatz
\code{lifoustim.mat}. Dieser enth\"at drei Variablen: 1. die
Spikezeiten, 2. den Stimulus und 3. die zeitliche Aufl\"osung. Die
Dauer eines Trials betr\"agt 30 Sekunden.
\begin{parts} \begin{parts}
\part Schreibt eine Funktion, die einen Vektor mit Spikezeiten, \part Schreibt eine Funktion, die einen Vektor mit Spikezeiten,
die Dauer des Trials, und die zeitliche Aufl\"osung entgegennimmt die Dauer des Trials, und die zeitliche Aufl\"osung entgegennimmt
und die Zeitachse sowie die Feuerrate zur\"uckgiebt. und die Zeitachse sowie die Feuerrate zur\"uckgibt.
\part Benutzt diese Funktion in einem Skript und stellt das PSTH \part Benutzt diese Funktion in einem Skript und stellt das PSTH
eines einzelnen Trials sowie den Mittelwert \"uber alle Trials eines einzelnen Trials sowie den Mittelwert \"uber alle Trials
dar. dar.
\part Erweitert das Programm so, dass die Abbildung den Standards \part Erweitert das Programm so, dass die Abbildung den Richtlinien
z.B. vom \textit{Journal of Neuroscience} entspricht des \textit{Journal of Neuroscience} entspricht
(Schriftgr\"o{\ss}e, Abbildungsgr\"o{\ss}e). (Schriftgr\"o{\ss}e, Abbildungsgr\"o{\ss}e).
\part Die Abbildung sollte als pdf gespeichert werden. \part Die Abbildung sollte als pdf gespeichert werden.
\end{parts} \end{parts}
@ -62,13 +66,13 @@
Abbildungen sollten nat\"urlich ``publikationsreif'' sein und Abbildungen sollten nat\"urlich ``publikationsreif'' sein und
gespeichert werden. gespeichert werden.
\question Einige trials sind anders als die \"Ubrigen. Benutzt den \question Einige Trials sind anders als die \"Ubrigen. Benutzt den
Rasterplot um sie zu finden. Speichert alle Abbildungen in Rasterplot um sie zu finden. Alle erstellten Abbildungen sollen in
``publikationsreifer'' Form. ``publikationsreifer'' Form gespeichert werden.
\begin{parts} \begin{parts}
\part Benutzt den Rasterplot um sie zu finden. \part Benutzt den Rasterplot um sie zu finden.
\part Plottet die Verteilung der Spike counts. \part Plottet die Verteilung der Spike counts.
\part Filtert all die trials heraus, deren spike count mehr als \part Filtert all die Trials heraus, deren Spikecount mehr als
$2\sigma$ vom Mittelwert abweicht. $2\sigma$ vom Mittelwert abweicht.
\part Plottet das PSTH vor und nach dem Filtern. \part Plottet das PSTH vor und nach dem Filtern.
\end{parts} \end{parts}