Merge branch 'master' of raven.am28.uni-tuebingen.de:scientificComputing
Conflicts: plotting/lecture/plotting.tex regression/lecture/regression.tex
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commit
5df5d77e40
@ -233,7 +233,7 @@
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% The cooler programming language.
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\usepackage[within=chapter]{newfloat}
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\DeclareFloatingEnvironment[
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fileextension=lob,
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fileext=lob,
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listname={\tr{Info Boxes}{Infoboxen}},
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name={Info Box},
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placement=t
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@ -264,17 +264,17 @@ als Funktion eines Stimulusparameters ist dann die ``Tuning-curve''
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\begin{figure}[tp]
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\includegraphics[width=1\textwidth]{mlecoding}
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\titlecaption{\label{mlecodingfig} Maximum Likelihood Sch\"atzung eines
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Stimulusparameters aus der Aktivit\"at einer Population von
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Neuronen.}{Oben: Die Tuning-Kurve eines einzelnen Neurons in
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Abh\"angigkeit von der Orientierung eines Balkens. Der Stimulus
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der die st\"akste Aktivit\"at in diesem Neuron hervorruft ist ein
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senkrechter Balken (Pfeil, $\phi_i=90$\,\degree. Die rote Fl\"ache
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deutet die Variabilit\"at $p(r)$ der Aktivit\"at $r$ um die
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Tuning-Kurve herum an. Mitte: Jedes Neuron in der Population hat
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eine andere bevorzugte Orientierung des Stimulus (farbige Linien).
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Ein Stimulus einer bestimmten Orientierung aktiviert die Neurone
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in spezifischer Weise (Punkte). Unten: Die Log-Likelihood dieser
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\titlecaption{\label{mlecodingfig} Maximum Likelihood Sch\"atzung
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eines Stimulusparameters aus neuronaler Aktivit\"at.}{Oben:
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Die Tuning-Kurve eines einzelnen Neurons in Abh\"angigkeit von der
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Orientierung eines Balkens. Der Stimulus der die st\"akste
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Aktivit\"at in diesem Neuron hervorruft ist ein senkrechter Balken
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(Pfeil, $\phi_i=90$\,\degree. Die rote Fl\"ache deutet die
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Variabilit\"at $p(r)$ der Aktivit\"at $r$ um die Tuning-Kurve
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herum an. Mitte: Jedes Neuron in der Population hat eine andere
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bevorzugte Orientierung des Stimulus (farbige Linien). Ein
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Stimulus einer bestimmten Orientierung aktiviert die Neurone in
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spezifischer Weise (Punkte). Unten: Die Log-Likelihood dieser
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Aktivit\"aten wir maximal in der N\"ahe der wahren Orientierung
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des Stimulus.}
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\end{figure}
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@ -11,7 +11,7 @@ all: pdf slides thumbs
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# script:
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pdf : $(BASENAME)-chapter.pdf
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$(BASENAME)-chapter.pdf : $(BASENAME)-chapter.tex $(BASENAME).tex $(GPTTEXFILES) $(PYPDFFILES)
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$(BASENAME)-chapter.pdf : $(BASENAME)-chapter.tex $(BASENAME).tex $(GPTTEXFILES) $(PYPDFFILES) ../../header.tex
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pdflatex -interaction=scrollmode $< | tee /dev/stderr | fgrep -q "Rerun to get cross-references right" && pdflatex -interaction=scrollmode $< || true
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@ -62,7 +62,7 @@ nicht auf die genaue Lage der Datenpunkte ankommt.
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\begin{figure}[t]
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\includegraphics[width=0.7\columnwidth]{outlier}\vspace{-3ex}
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||||
\titlecaption{Comicartige Darstellungen}{ sind f\"ur die Darstellung
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\titlecaption{Comicartige Darstellungen.}{Sie sind f\"ur die Darstellung
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wissenschaftlicher Daten nicht geeignet. F\"ur illustrative Beispiele
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k\"onnen sie aber helfen, die wesentlichen Aspekte zu betonen.}\label{comicexamplefig}
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\end{figure}
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@ -244,7 +244,7 @@ die Farbe und die verschiedenen Marker.
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\titlecaption{Vordefinierte Linienstile (links), Farben (Mitte) und Markersymbole (rechts).}{}\label{plotlinestyles}
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\begin{minipage}[t]{0.3\textwidth}
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\vspace{0pt}
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\begin{tabular}{c|l}
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\begin{tabular}{lc} \hline
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\textbf{Linienstil} & \textbf{K\"urzel} \\\hline
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durchgezogen & '\verb|-|' \\
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gestrichelt & '\verb|--|' \\
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@ -256,7 +256,7 @@ die Farbe und die verschiedenen Marker.
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\begin{minipage}[t]{.3\textwidth}
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\vspace{0pt}
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\hspace{0.05\textwidth}
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\begin{tabular}{lc}
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\begin{tabular}{lc} \hline
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\textbf{Farbe} & \textbf{K\"urzel} \\ \hline
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Rot & 'r'\\
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Gr\"un & 'g' \\
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@ -270,7 +270,7 @@ die Farbe und die verschiedenen Marker.
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\vspace{0pt}
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\begin{minipage}[t]{0.3\textwidth}
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\vspace{0pt}
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\begin{tabular}{lc}
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\begin{tabular}{lc} \hline
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\textbf{Markersymbol} & \textbf{K\"urzel} \\ \hline
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Kreis & 'o'\\
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Stern & '*' \\
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@ -362,11 +362,11 @@ gerade aktiven Achse.
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\codeterm{PaperSize} & Gr\"o{\ss}e der des Papiers. & 2-elementiger Vektor mit der Papiergr\"o{\ss}e.\\
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\codeterm{PaperUnits} & Einheit, in der die Papiergr\"o{\ss}e bestimmt wird. & $\{'inches' | 'centimeters' | 'normalized' | 'points'\}$\\
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||||
\codeterm{Visible} & Hilfreich, wenn ein Plot aus Performanzgr\"unden nicht auf dem Bildschirm gezeigt, sondern direkt gespeichert werden soll. & $\{'on' | 'off'\}$\\ \hline
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\end{tabular}
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\end{tabular*}
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\end{table}
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Wie die Achse, hat auch das \codeterm{Figure} Element eine Reihe von
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Eigenschaften, die nach Bedarf mit der \cide{set} - Funktion gesetzt
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Eigenschaften, die nach Bedarf mit der \code{set} - Funktion gesetzt
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werden k\"onnen (Tabelle \ref{plotfigureprops} listet die
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meistverwendeten). Das erste Argument f\"ur \code{set()} ist jetzt
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aber eine Handle f\"ur die Abbildung, nicht das
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@ -385,7 +385,7 @@ erstes Argument wieder ein Handle auf die Figure erwartet. Das zweite
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Argument ist der Dateiname, und zuletzt muss das gew\"unschte Format
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(Box \ref{graphicsformatbox}) angegeben werden.
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\begin{lstlisting}[caption={Skript zur Erstellung des Plots in Abbildung \ref{spikedetectionfig}.}, label=niceplotlisting]
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\begin{lstlisting}[caption={Skript zur Erstellung des Plots in \figref{spikedetectionfig}.}, label=niceplotlisting]
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figure()
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set(gcf, 'PaperUnits', 'centimeters', 'PaperSize', [11.7 9.0]);
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set(gcf, 'PaperPosition',[0.0 0.0 11.7 9.0], 'Color', 'white')
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@ -578,7 +578,7 @@ Eine elementweise Multiplikation (\code{.*} Operator, Listing
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1 5 9
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5 10 5
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>>
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>> A * B % Matrix Multiplikation
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>> A * B % Matrixmultiplikation
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ans =
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24 63 103
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29 82 119
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@ -593,6 +593,8 @@ Eine elementweise Multiplikation (\code{.*} Operator, Listing
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\begin{ibox}[t]{\label{matrixmultilication} Matrixmultiplikation.}
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\end{ibox}
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\section{Boolesche Operationen}
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@ -11,11 +11,11 @@ ein Optimierungsproblem, der als Kurvenfit bekannt ist
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\begin{figure}[t]
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\includegraphics[width=1\textwidth]{lin_regress}\hfill
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\titlecaption{Parameter der linearen Geradengleichung.}{F\"ur eine Reihe von Eingangswerten $x$,
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z.B. Stimulusintensit\"aten, wurden die Antworten $y$ eines
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Systems gemessen (links). Der postulierte lineare Zusammenhang hat
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als freie Parameter die Steigung (mitte) und den
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$y$-Achsenabschnitt (rechts).}\label{linregressiondatafig}
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\titlecaption{Beispieldatensatz f\"ur den Geradenfit.}{F\"ur eine
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Reihe von Eingangswerten $x$, z.B. Stimulusintensit\"aten, wurden
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||||
die Antworten $y$ eines Systems gemessen (links). Der postulierte
|
||||
lineare Zusammenhang hat als freie Parameter die Steigung (mitte)
|
||||
und den $y$-Achsenabschnitt (rechts).}\label{linregressiondatafig}
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\end{figure}
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Die Punktewolke in \figref{linregressiondatafig} legt
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@ -217,13 +217,12 @@ Standardabweichung $\sigma$.
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\begin{figure}[t]
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\includegraphics[width=1\textwidth]{pdfhistogram}
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\titlecaption{\label{pdfhistogramfig} Histogramme mit
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verschiednenen Klassenbreiten eines Datensatzes von
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normalverteilten Messwerten.}{Links: Die H\"ohe des absoluten
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Histogramms h\"angt von der Klassenbreite ab. Rechts: Bei auf
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das Integral normierten Histogrammen werden auch
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unterschiedliche Klassenbreiten untereinander vergleichbar und
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auch mit der theoretischen Wahrschinlichkeitsdichtefunktion
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\titlecaption{\label{pdfhistogramfig} Histogramme mit verschiednenen
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||||
Klassenbreiten von normalverteilten Messwerten.}{Links: Die H\"ohe
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des absoluten Histogramms h\"angt von der Klassenbreite
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||||
ab. Rechts: Bei auf das Integral normierten Histogrammen werden
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||||
auch unterschiedliche Klassenbreiten untereinander vergleichbar
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||||
und auch mit der theoretischen Wahrschinlichkeitsdichtefunktion
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(blau).}}
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\end{figure}
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@ -261,8 +260,7 @@ $\Delta x$ der Klassen geteilt werden (\figref{pdfhistogramfig}).
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\begin{figure}[tp]
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\includegraphics[width=1\textwidth]{correlation}
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\titlecaption{\label{correlationfig} Korrelationen zwischen zwei
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Datens\"atzen $x$ und $y$.}{}
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\titlecaption{\label{correlationfig} Korrelationen zwischen Datenpaaren.}{}
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\end{figure}
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||||
Bisher haben wir Eigenschaften einer einzelnen Me{\ss}gr\"o{\ss}e
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@ -285,10 +283,11 @@ nur unzureichend oder \"uberhaupt nicht erfasst (\figref{nonlincorrelationfig}).
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\begin{figure}[tp]
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||||
\includegraphics[width=1\textwidth]{nonlincorrelation}
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||||
\titlecaption{\label{nonlincorrelationfig} Nichtlineare Zusammenh\"ange
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werden durch den Korrelationskoeffizienten nicht erfasst.}{Sowohl
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die quadratische Abh\"angigkeit (links) als auch eine
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Rauschkorrelation (rechts), bei der die Streuung der $y$-Werte von
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||||
$x$ abh\"angen, ergeben Korrelationskeffizienten nahe Null.
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||||
$\xi$ sind normalverteilte Zufallszahlen.}
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||||
\titlecaption{\label{nonlincorrelationfig} Korrelationen von
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||||
nichtlineare Zusammenh\"angen.}{Der Korrelationskoeffizienten
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||||
erfasst nur lineare Zusammenh\"ange. Sowohl die quadratische
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||||
Abh\"angigkeit (links) als auch eine Rauschkorrelation (rechts),
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||||
bei der die Streuung der $y$-Werte von $x$ abh\"angen, ergeben
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||||
Korrelationskeffizienten nahe Null. $\xi$ sind normalverteilte
|
||||
Zufallszahlen.}
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||||
\end{figure}
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Reference in New Issue
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