nicer nice plot with data and script

plotting/code/automatic_plot.m

@@ -0,0 +1,30 @@
+clear all
+close all
+
+load('pyramidal_response.mat')
+threshold = 20; % mV
+
+figure()
+hold on
+plot(time, neuronal_data, 'color', [0.2 0.5 0.7], 'linewidth', 1., ...
+    'displayname', 'membrane voltage')
+plot(spikes, ones(size(spikes)) .* threshold, 'ro', 'markersize', 5, ...
+    'displayname', 'spike times')
+line([time(1) time(end)], [threshold threshold], 'linestyle', '--', ...
+    'linewidth', 0.75, 'color', [0.5 0.5 0.9], 'displayname', 'threshold')
+
+xlabel('time [s]', 'fontname', 'Times', 'fontsize', 11)
+ylabel('potential [mV]', 'fontname', 'Times', 'fontsize', 11)
+title('ELL pyramidal neuron', 'fontname', 'Times', 'fontsize', 12)
+ylim([0 35])
+xlim([0 2.25])
+box('off')
+l = legend(gca,'show');
+set(l,'Location','northwest', 'Fontsize', 7, 'LineWidth', 1.);
+set(gca, 'XMinorTick','on','yMinorTick','on')
+set(gca, 'TickDir','out', 'linewidth', 1.5, 'fontname', 'Times', ...
+    'fontsize', 11)
+set(gcf, 'PaperUnits', 'centimeters', 'PaperSize', [15 7.5]);
+set(gcf, 'PaperPosition',[0.0 0.0 15, 7.5], 'Color', 'white')
+
+saveas(gcf, [pwd '/../lecture/images/spike_detection.pdf'], 'pdf')

plotting/lecture/plotting.tex

@@ -385,27 +385,10 @@ erstes Argument wieder ein Handle auf die Figure erwartet. Das zweite
 Argument ist der Dateiname, und zuletzt muss das gew\"unschte Format
 (Box \ref{graphicsformatbox}) angegeben werden.
 
-\begin{lstlisting}[caption={Skript zur Erstellung des Plots in \figref{spikedetectionfig}.}, label=niceplotlisting]
+\lstinputlisting[caption={Skript zur Erstellung des Plots in \figref{spikedetectionfig}.}, label=niceplotlisting]{automatic_plot.m}
-figure()
-set(gcf, 'PaperUnits', 'centimeters', 'PaperSize', [11.7 9.0]);
-set(gcf, 'PaperPosition',[0.0 0.0 11.7 9.0], 'Color', 'white')
-hold on
-plot(time, neuronal_data, 'color', [ 0.2 0.5 0.7], 'linewidth', 1.)
-plot(spike_times, ones(size(spike_times))*threshold, 'ro', 'markersize', 4)
-line([time(1) time(end)], [threshold threshold], 'linestyle', '--',
-    'linewidth', 0.75, 'color', [0.9 0.9 0.9])
-ylim([0 35])
-xlim([0 2.25])
-box('off')
-xlabel('time [s]', 'fontname', 'MyriadPro-Regular', 'fontsize', 10)
-ylabel('potential [mV]', 'fontname', 'MyriadPro-Regular', 'fontsize', 10)
-title('pyramidal cell', 'fontname', 'MyriadPro-Regular', 'fontsize', 12)
-set(gca, 'TickDir','out', 'linewidth', 1.5, 'fontname', 'MyriadPro-Regular')
-saveas(gcf, 'spike_detection.pdf', 'pdf')
-\end{lstlisting}
 
 \begin{figure}
-  \includegraphics[width=0.5\columnwidth]{spike_detection}
+  \includegraphics{spike_detection}
   \titlecaption{Automatisch erstellter Plot.}{Dieser Plot wurde vollst\"andig
     mit dem Skript in Listing \ref{niceplotlisting} erstellt und
     gespeichert.}\label{spikedetectionfig}

programming/lecture/scripts_functions-slides.tex

@@ -563,7 +563,7 @@ legend('show')
 \begin{frame}[fragile]
   \frametitle{Skripte und Funktionen}
   \framesubtitle{Programmierstil}
-  In verschiednen Sprachen verschiedene Konventionen. In MATLAB ...
+  In verschiedenen Sprachen verschiedene Konventionen. In MATLAB ...
   \begin{itemize}
   \item Funktionen, Skripte: Kleinbuchstaben, Abk\"urzungen. (z.B. \verb+xcorr+, \verb+repmat+)
   \item Konvertierungen immer mit format2format (z.B. \verb+num2str+)