from read_chirp_data import * import nix_helpers as nh import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np from IPython import embed data_dir = "../data" dataset = "2018-11-09-ad-invivo-1" data = ("2018-11-09-ad-invivo-1", "2018-11-09-ae-invivo-1", "2018-11-09-ag-invivo-1", "2018-11-13-aa-invivo-1", "2018-11-13-ac-invivo-1", "2018-11-13-ad-invivo-1", "2018-11-13-ah-invivo-1", "2018-11-13-ai-invivo-1", "2018-11-13-aj-invivo-1", "2018-11-13-ak-invivo-1", "2018-11-13-al-invivo-1", "2018-11-14-aa-invivo-1", "2018-11-14-ac-invivo-1", "2018-11-14-ad-invivo-1", "2018-11-14-af-invivo-1", "2018-11-14-ag-invivo-1", "2018-11-14-ah-invivo-1", "2018-11-14-ai-invivo-1", "2018-11-14-ak-invivo-1", "2018-11-14-al-invivo-1", "2018-11-14-am-invivo-1", "2018-11-14-an-invivo-1") #for dataset in data: eod = read_chirp_eod(os.path.join(data_dir, dataset)) times = read_chirp_times(os.path.join(data_dir, dataset)) df_map = {} #Keys werden nach df sortiert ausgegeben for k in eod.keys(): df = k[1] ch = k[3] if df in df_map.keys(): df_map[df].append(k) else: df_map[df] = [k] #print(ch) #die Chirphöhe wird ausgegeben, um zu bestimmen, ob Chirps oder Chirps large benutzt wurde #die äußere Schleife geht für alle Keys durch und somit durch alle dfs #die innnere Schleife bildet die 16 Wiederholungen einer Frequenz in 4 Subplots ab for i in df_map.keys(): freq = list(df_map[i]) fig,axs = plt.subplots(2, 2, sharex = True, sharey = True) for idx, k in enumerate(freq): ct = times[k] e1 = eod[k] zeit = e1[0] eods = e1[1] if idx <= 3: axs[0, 0].plot(zeit, eods, color= 'blue', linewidth = 0.25) axs[0, 0].scatter(np.asarray(ct), np.ones(len(ct))*3, color = 'green', s= 22) elif 4<= idx <= 7: axs[0, 1].plot(zeit, eods, color= 'blue', linewidth = 0.25) axs[0, 1].scatter(np.asarray(ct), np.ones(len(ct))*3, color = 'green', s= 22) elif 8<= idx <= 11: axs[1, 0].plot(zeit, eods, color= 'blue', linewidth = 0.25) axs[1, 0].scatter(np.asarray(ct), np.ones(len(ct))*3, color = 'green', s= 22) else: axs[1, 1].plot(zeit, eods, color= 'blue', linewidth = 0.25) axs[1, 1].scatter(np.asarray(ct), np.ones(len(ct))*3, color = 'green', s= 22) fig.suptitle('EOD for chirps', fontsize = 16) axs[0,0].set_ylabel('Amplitude [mV]') axs[0,1].set_xlabel('Amplitude [mV]') axs[1,0].set_xlabel('Time [ms]') axs[1,1].set_xlabel('Time [ms]') #axs kann nur einzelne Label erzeugen, nicht generell möglich wie beim Titel for i in df_map.keys(): freq = list(df_map[i]) ct = times[freq[1]] ct1 = ct[1] e1 = eod[k] zeit = np.asarray(e1[0]) ampl = np.asarray(e1[1]) time_cut = zeit[(zeit > ct1-25) & (zeit < ct1+25)] eod_cut = ampl[(zeit > ct1-25) & (zeit < ct1+25)] change = ampl[int(ct1)] plt.figure(12) plt.plot(time_cut, eod_cut) plt.scatter(ct1, 3, color = 'green', s= 30) plt.title('Chirp reaction Ampl.') plt.xlabel('Time [ms]') plt.ylabel('Amplitude[mV]') #plt.show() #4. Chirps einer Phase zuordnen - zusammen plotten? #next Step: EOD-Amplitudenmodulation für beat aber OHNE Chirps plotten #allerdings: in der Aufnahme sind nur kurze Zeitfenster ohne Chirps zu finden!